总公司应当承担责任，诉讼时可以将总公司和分公司一并列为被告。列分公司为民事责任主体应是有法律依据的。根据故诉讼时，也可以列总公司为被告，要求其承担责任。一般判决分公司承担责任，分公司力承担的由总公司承担补充责任。第二、执行过程中可以追加总公司为被执行人《最高人民关于人民执行工作若干问题的规定(试行)》第7规定，被执行人为企业法人的分支机构不能清偿债务时，可以裁定企业法人为被执行人。企业法人直接经营管理的财产仍不能清偿债务的，人民可以裁定执行该企业法人其他分支机构的财产。司法解释同时还规定了分支机构的财产不足清偿的，可追加其总公司作为被执行人。上述法律规定已经很明确了诉讼程序与执行程序对于此类问题的前后解决方案，当事人为了简便和出于最大程度保护自己权利的考虑，最好诉讼时就将其列为被告。因为执行过程中追加被执行人，仍然需要出具裁定书，需要开庭，这样更加麻烦。
一、分公司是否可以作为被告？
分公司是否可以作为被告分为以下情况：
1、如果分公司有很强的偿付能力，应该只以分公司为被告；
2、如果分支机构存在，但其偿付能力较差或没有偿付能力，原告可以分支机构和总部为共同被告或只有总部为被告；
3、分公司关闭或者撤销的，以总公司为被告。
原告起诉时，分公司关闭或者撤销的，其民事责任承担能力消亡，不能享有诉讼主体资格，其权利义务由总公司直接承担。
二、总公司作为法人，具有企业法人资格，分公司一般不具有法人资格，两者之间的区别及债务如何承担如下：
1、企业法人无力偿还债务时，却可以其不具法人资格的分支机构财产清偿。
《最高人民关于企业法人无力偿还债务时，可否执行其分支机构财产问题的复函》明确答复，企业法人的经营活动由其分支机构的经营行为具体体现，分支机构经营管理的财产是企业法人经营管理的财产或者属企业法人所有的财产，仍为企业法人对外承担民事责任的物质基础。对企业法人的债务可以裁定由企业法人的分支机构负责偿还。
2、不具法人资格的企业法人分支机构的债务，由企业法人负担。
(1)《公司法》第13条规定：“公司可以设立分公司，分公司不具有企业法人资格，其民事责任由公司承担。”
(2)《最高人民关于贯彻执行若干问题的意见》第107条规定；“不具有法人资格的企业法人的分支机构，以自己的名义对外签订保证合同，一般应当认定无效。但因此产生的财产责任，分支机构如有偿付能力的，应当自行承担；如无偿付能力的，由企业法人负担。”
(3)《最高人民关于不具备法人资格的企业分支机构作为经营合同一方当事人的保证人，其保证合同是否有效及发生纠纷时如何处理问题的批复》答复：此种情况应认定保证合同无效。“企业法人的分支机构如无代为履行或者代偿能力，在有关保证责任的诉讼中应将该企业法人列为诉讼当事人，并承担保证人应承担的民事责任。”
注册中国商标，可以是个人或者企业主体，企业主体不分总公司或者分公司，谁先注册下来，就归属谁。注册成功后商标可以转让以及授权，分公司注册下来也可以转让或授权给总公司。当然分公司的商标与总公司的关系还要看总公司与分公司间资源分配关系，因为商标是无形资产的一种形式，也就是说商标是资产的一种形式，所以如果说分公司的商标与总公司毫无关系，也是不甚严谨的。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》第四十九条公民、法人和其他组织可以作为民事诉讼的当事人。《中华人民共和国公司法》第十三条公司可以设立分公司，分公司不具有企业法人资格，其民事责任由公司承担。